B отстойниках с двумя ярусами дополнительные приспособления, такие как осадочные желоба, лотки (распределительные и сборные), водосливы (точнее – их гребни), доски погружные и некоторые другие регулируются и отлаживаются сначала на воде чистой, а затем только на рабочей – сточной.
Погружные доски регулируются на чистой воде с добавлением красящего вещества. Для равномерности распределения воды в системе с несколькими эмшерами на подводящих лотках используется такое простое регулирующее устройство, как шиберная задвижка. Необходимо соблюсти условия, обеспечивающие нормальное щелочное брожение осадка, выпадающего в иловой камере. Для этого в двухъярусный отстойник вначале загружается полностью перегнивший (так называемый зрелый) осадок. Источником этого материала может быть отлаженный ранее такой же отстойник или септик. При отсутствии в доступной окрестности таких сооружений можно воспользоваться содержимым не очищавшихся 1-2 года выгребных ям.
Созревший осадок располагают на дне иловой камеры, свободной от сточной жидкости. Если загружаемый ил не дозрел, то процесс можно ускорить гашеной известью, добавляемой время от времени. Необходимо следить за тем, чтобы рН не был выше 8.
Допускается вводить в эксплуатацию двухъярусный отстойник и при невозможности либо экономической нецелесообразности добывать зрелый осадок. Тогда следует ограничиться созреванием имеющегося осадка природным путем. Процесс займёт от полугода до года – срок зависит от температурных особенностей климата местности. Для ускорения процесса гниения рекомендуется приурочить ввод двухъярусного отстойника в эксплуатацию к тёплому сезону.
Для контроля работы сооружения во время пуска и наладки достаточно персонала лаборатории, который заодно приобретёт и опыт в обслуживании конкретного сооружения.
После пуска в работу двухъярусного отстойника необходимо постепенно наращивать его нагрузку до расчётной, непрерывно следя за его работоспособностью. Нельзя допускать перегрузки, поскольку в этом случае вода будет осветляться с меньшей эффективностью. Перегрузка также выведет из нормального режима иловую камеру.
Если в комплексе не один двухъярусный отстойник, то они будут работать в нормальном режиме, когда стоки будут распределяться между ними с максимальной равномерностью. Чтобы осадки в спаренных отстойниках выпадали также равномерно, поток подаваемых в них стоков рекомендуется по направлению регулярно менять – в месяц 2-3 раза.